無菌室設計一般有如下的要求：

無菌操作間的潔凈度應達到10000級，室內溫度保持在20℃~24℃，濕度保持在45%~60%，超凈臺潔凈度應達到100級。無菌室應每月檢查菌落數，在無菌室或超凈工作臺開啟的狀態下，取內徑90mm的無菌培養皿若干，無菌操作分別注入融化并冷卻至約45℃的平板計數瓊脂培養基的15mL，放至凝固后，倒置于36℃±1℃培養箱培養48h，取出檢查。100級潔凈區平板雜菌數平均不得超過1個菌落，10000級的潔凈室平均不得超過3個菌落，如超過限度，應對無菌室進行徹底消毒，直至重復檢查合乎要求為止。